هسته اولیه دانشکده فیزیک دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی کار خود را از سال ۱۳۵۸ و با ارائه دروس فیزیک پایه به دانشکده های فنی و مهندسی دانشگاه آغاز نمود، و پس از آن در سال های ۱۳۶۹ و ۱۳۷۱ به ترتیب با اخذ مجوزهای لازم، دوره های کارشناسی و کارشناسی ارشد را دایر کرده و شروع به پذیرش دانشجو در رشته فیزیک نمود. این مجموعه تا سال ۱۳۹۲ تحت عنوان گروه فیزیک شناخته می‌شد و به همراه گروه های ریاضی و شیمی، دپارتمان های دانشکده علوم دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی را تشکیل می‌دادند، از سال ۱۳۹۲ و پس از اخذ تأییدهای لازم، این سه گروه به دانشکده های جداگانه تبدیل شدند. درحال حاضر دانشکده های فیزیک و شیمی در مجموعه پردیس علوم دانشگاه صنعتی خواجه نصیرالدین طوسی به فعالیت علمی و پژوهشی خود ادامه می دهند.

ریاست دانشکده فیزیک از سال ۱۳۹۲ تاکنون در دوره های دو ساله برعهده افراد زیر بوده است:

دکتر حسین حمزه پور (بهمن ۱۴۰۱-تاکنون)

دکتر مجید واعظ زاده (مهر۱۴۰۱-دی ۱۴۰۱ )

دکتر سید فرهاد مسعودی (۱۳۹۶ تا ۱۴۰۱)

دکتر مجید واعظ زاده (۱۳۹۴ تا ۱۳۹۶)

دکتر سید محسن صالح کوتاهی (۱۳۹۲ تا ۱۳۹۴)